

Analyses bioinformatiques avec Python
CNRS FORMATION
Objectif Général
Perfectionnement, élargissement des compétences
Objectif
- Savoir mener des analyses standards en bioinformatique avec Python et Biopython
- Accéder à l’information disponible dans les ressources en ligne à partir d’un script Python
- Être capable d'enrichir les résultats en utilisant des bases de données
- Apprendre à se servir des librairies Python pour présenter graphiquement ses résultats
Type
Formation non conventionnée
Financeur
FINANCEMENT INDIVIDUEL
Référence
Sans objet
Organisme responsable et contact
CNRS FORMATION
NomIvona RACIC Tél.01.69.82.44.97 Mailcfe.contact@cnrs.frDispositif
Non conventionnée / sans dispositif
Mesure
Non conventionnée / sans dispositif
Référence organisme
Sans objet
Conditions d'accès réglementaires
Sans objet
Prérequis pédagogiques
Avoir des notions en programmation et savoir utiliser un environnement Linux en mode ligne de commande. Il est souhaitable d’avoir déjà utilisé le langage Python
Publics visés
- Demandeur d'emploi
- Jeune de moins de 26 ans
- Personne handicapée
- Salarié(e)
- Actif(ve) non salarié(e)
Type de parcours
Individualisé
Parcours de formation personnalisable ?
Oui
Niveau d'entrée requis
Sans niveau spécifique
Sélection
- Inscription directe ou par un conseiller en insertion professionnelle
Accessible en contrat de professionnalisation ?
Non
Modalités d'enseignement (contacter l'organisme)
Sans objet
Validation de la formation
- Attestation de fin de formation
Programme
Cette formation introduira notamment les librairies Biopython, Numpy, Pandas et Matplotlib permettant la manipulation et l'analyse de données biologiques ainsi que la visualisation des résultats d’analyse.
- Rappels des concepts du langage Python
- Agrégation d’informations sur des gènes d’intérêts (recherche dans les bases de données, alignements multiples, annotation, phylogénie, etc.)
- Analyse des données de séquençage ADN (NGS) (prétraitement, annotation, analyse de résultats d’alignement et/ou SNP calling)
- L'analyse d'expression différentielle à partir de données RNA-seq ou protéomique
- Les méthodes d'enrichissement de résultats
- Les outils de visualisation de résultats et de génération de figures
Suite de parcours possible
Sans objet
Numéro Carif | Dates de formation | Ville | Organisme de formation | CPF | Info |
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Numéro Carif | Dates de formation | Ville | Organisme de formation | CPF | Info | ||||||
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00294332Publiée le 15/04/2022 | du 14/06/2022 au 17/06/2022 | Bordeaux (33) | CNRS FORMATION | Non éligible |
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Informations sur l'éligibilité au Compte Personnel de Formation (CPF)
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évolution professionnelle (CEP) plus d'infos
: ouverture de la formation à la candidature à venir
: ouvert à la candidature
: fermé à la candidature (date limite d'inscription dépassée et/ou plafond des candidatures autorisées atteint)
: formation terminée
